用于制備4-氨基-1-((1s,4r,5s)-2-氟-4,5-二羥基-3-羥甲基-環(huán)戊-2-烯基)-1h-嘧啶-2 ...的制作方法
【技術領域】
[0001] 本發(fā)明涉及用于制備4-氨基-1- ((1S,4R,5S) -2-氟-4, 5-二羥基-3-羥甲基-環(huán) 戊-2-烯基)-1H-嘧啶-2-酮及其中間體的方法。
【背景技術】
[0002]在美國專利吣.7,405,214 中公開了4-氨基-1-((13,41?,53)-2-氟-4,5-二羥 基-3-羥甲基-環(huán)戊-2-烯基)-lH-嘧啶-2-酮(RX-3117),
[0003]
[0004] 所述專利描述了合成方法以及治療方法。在美國專利No. 7, 405, 214中所述的方 法包括總共11個步驟來從D-核糖合成(3R,4R,6aR)-叔丁基-(5-氟-2, 2-二甲基-6-三 苯甲氧基甲基-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基氧基)-二苯基硅 燒,其是用于合成4_氛基-1- ((1S,4R,5S) _2_氣_4, 5_二羥基_3_輕甲基-環(huán)戊_2_稀 基)-lH-嘧啶-2-酮的重要中間體。美國專利No. 7, 405, 214使用昂貴的催化劑,這提出了 對實現(xiàn)工廠生產(chǎn)的挑戰(zhàn)。
[0005] 發(fā)明概述
[0006] 本發(fā)明公開了經(jīng)過(3R,4R,6aR)-叔丁基-(5-氟-2,2-二甲基-6-三苯甲氧基甲 基_4,6a_二氛_3aH_環(huán)戊二稀并[1,3]二氧雜環(huán)戊稀_4_基氧基)-二苯基硅烷來制備 4_氨基-1- ((1S,4R,5S) -2-氟-4, 5-二羥基-3-羥甲基-環(huán)戊-2-烯基)-1H-嘧啶-2-酮 的短路線。分別地描述了所述方法的每個步驟,并且可認為本發(fā)明是單獨步驟的任意一個 或步驟在一起的任意組合。
[0007] 在實施方案中,本發(fā)明是通過使4-氨基-l-(3aS,4S,6aR)-5-氟_2,2_二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基) 嘧啶-2(1H)-酮(12)與酸(例如HC1)反應來制備4-氨基-1-((15,41?,55)-2-氟-4,5-二 羥基-3-(羥甲基)-環(huán)戊-2-烯-1-基)-嘧啶-2(1H)_酮(13)的方法。
[0008] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aR,4R,6aR) -5-氟-2, 2-二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基 甲磺酸酯(11)與胞嘧啶反應來制備4-氨基-1-(3&3,43,6 &1?)-5-氟-2,2-二甲基-6-((三 苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基)嘧 啶-2(1H)-酮(12)。
[0009] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aS,4R,6aR) -5-氟-2, 2-二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇 (10) 與1^(:1反應來制備(3&1?,41?,6&1?)-5-氟-2,2-二甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)-4, 6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基甲磺酸酯(11)。
[0010] 所述方法的一些實施方案可包括通過對叔丁基(((3aR,4R,6aR)-5-氟_2,2_二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基) 氧基)二苯基硅烷(9)進行脫保護來制備(3&3,41?,6&1?)-5-氣-2,2-二甲基-6-((二苯甲 氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(10)。
[0011] 所述方法的一些實施方案可包括通過使叔丁基(((3aR,4R,6aR)-5-碘_2,2_二 甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊 烯-4-基)氧基)二苯基硅烷(8)與NFSI(N-氟苯磺酰亞胺)反應來制備叔丁基(((3aR, 4R,6aR)-5-氟-2,2-二甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基)氧基)二苯基硅烷(9)。
[0012] 所述方法的一些實施方案可包括通過將叔丁基(((3aR,4R,6aR)-5_碘_2,2_二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基) 氧基)二苯基硅烷(8)轉化為硼酸中間體,然后水解并與1-氯甲基-4-氟_1,4_二氮雜雙 環(huán)[2. 2. 2]辛烷雙(四氟硼酸鹽)(Sele_flllO:r_ )反應來制備(3&3,41?,6&1?)-5-氟-2, 2-二甲基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊 烯-4-醇(9)。在一些實施方案中,硼酸中間體為[(3aR,6S,6aR)-6-[叔丁基(二苯基)甲 硅烷基]氧基_2,2_二甲基_4_(三苯甲氧基甲基)-6,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1, 3]二氧雜環(huán)戊烯-5-基]硼酸(9c-l),并且通過叔丁基(((3&1?,41?,6&1?)-5-碘-2,2-二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基) 氧基)二苯基硅烷(8)與硼酸三甲酯的反應來制備。在一些實施方案中,硼酸中間體為 [(3aR,6S,6aR) -2,2-二甲基-5- (4,4, 5,5-四甲基-1,3,2-二氧雜環(huán)戊硼烷-2-基)-4-(三 苯甲氧基甲基)_6,6a_二氫_3aH_環(huán)戊二稀并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊稀_6_基]氧基-叔 丁基-二苯基硅烷(9c-2),其通過使叔丁基(((3aR,4R,6aR) -5-碘-2,2-二甲基-6-((三 苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基)氧基) 二苯基硅烷(8)與4,4,5,5_四甲基_1,3,2_二氧雜環(huán)戊硼烷反應來制備。
[0013] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aS,4R,6aR) -5-碘-2, 2-二甲 基_6_((三苯甲氧基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇 (7)與t-BDPSCl反應來制備叔丁基(((3&1?,41?,6&1?)-5-碘-2,2-二甲基-6-((三苯甲氧 基)甲基)-4,6a-二氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-基)氧基)二苯基 硅烷(8)。
[0014] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aR,6aR)-5_碘_2,2-二甲基-6-((三 苯甲氧基)甲基)-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4(6aH)_酮(6)與CeCljP 似8114反應來制備(3&3,41?,6&1?)-5-碘-2,2-二甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)-4,6 &-二 氫-3aH-環(huán)戊二烯并[d] [1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(7)。
[0015] 所述方法的一些實施方案可包括通過氧化(1R,4S,5S)-2-碘-4, 5-亞異丙基二氧 基-l-(三苯甲氧基甲基)環(huán)戊-2-烯醇(5)來制備(3aR,6aR)-5-碘-2,2-二甲基-6-((三 苯甲氧基)甲基)-3aH-環(huán)戊二烯并[d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4(6aH)_酮(6)。氧化可使用 例如重絡酸吡啶.纖(pyridiniumdichromate,PDC) 〇
[0016] 所述方法的一些實施方案可包括通過使l-((4S,5S)-5-(2,2-二碘乙烯基)-2, 2-二甲基-1,3-二氧雜環(huán)戊烷-4-基)-2-(三苯甲氧基)乙酮(4)與n-BuLi反應來制備 (lR,4S,5S)-2-碘_4,5_亞異丙基二氧基-1-(三苯甲氧基甲基)環(huán)戊-2-烯醇(5)。
[0017] 所述方法的一些實施方案可包括通過氧化1-((41?,53)-5-(2,2-二碘乙烯基)-2, 2-二甲基-1,3-二氧雜環(huán)戊烷-4-基)-2-(三苯甲氧基)乙醇(3)來制備1-((4S, 5S) -5- (2, 2- 二鵬乙烯基)-2, 2- __甲基-1,3- 二氧雜環(huán)戊燒_4-基)(二苯甲氧基)乙 酮(4)。氧化步驟可例如用重鉻酸吡啶鑛(roc)來進行或者通過使用二異丙基碳二亞胺、P比啶、三氟乙酸(CF3C00H)和次氯酸鈉(NaOCl)的斯韋恩氧化(Swernoxidation)來進行。
[0018] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aR,6aR)-2, 2-二甲基-6-((三苯甲氧 基)甲基)四氫呋喃并[3,4-d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇⑵與碘仿反應來制備1-((4R, 5S) -5- (2, 2- 二鵬乙烯基)-2, 2- __甲基-1,3- 二氧雜環(huán)戊燒_4-基)(二苯甲氧基)乙 醇⑶。
[0019]所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aR,6aR) -6-(羥甲基)-2,2-二甲基四 氫呋喃并[3,4-d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(1)與三苯甲基氯反應來制備(3aR,6aR)-2, 2-二甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)四氫呋喃并[3,4-(1][1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(2)。
[0020] 所述方法的一些實施方案可包括通過使(3aR,6aR)-6-(羥甲基)-2,2-二甲基四 氫呋喃并[3,4-d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(1)與三苯甲基氯反應來制備(3aR,6aR)-2, 2-二甲基-6-((三苯甲氧基)甲基)四氫呋喃并[3,4-(1][1,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(2)。
[0021] 所述方法的一些實施方案可包括例如通過使D-核糖與2,2_二甲氧基丙烷反應或 者通過在酸的存在下使D-核糖與丙酮反應來制備(3aR,6aR) -6-(羥甲基)-2, 2-二甲基四 氫呋喃并[3,4-d][l,3]二氧雜環(huán)戊烯-4-醇(1)。
[0022] 通過以下說明和非限制性實施例,本發(fā)明的其他目的和優(yōu)點以及一些優(yōu)選實施方 案的結構和功能將變得明顯。
[0023] 發(fā)明詳述
[0024] 以下詳細地討論了本發(fā)明的一些實施方案。在描述一些實施方案中,為了清楚的 目的而使用了特定術語。然而,本發(fā)明并不旨在受限于所選擇的特定術語。雖然討論了特 定的示例性實施方案,但是應理解,這僅是為了舉例說明的目的。相關領域技術人員應承 認,在不脫離本發(fā)明的精神和范圍的情況下,可使用其他組分和構造。本文中引用的所有 參考文獻均通過引用并入本文,如同其各自單獨地并入。本申請要求保護美國臨時申請 No. 61/800, 475的權益,其通過引用以其整體并入本文。
[0025] 已知核苷是DNA和RNA大分子中的亞基,并且除了其在細胞生物合成途徑中的功 能之外,其還在神經(jīng)傳遞(Baldwin,S.A. ;Mackey,J.R. ;Cass,C.E. ;Young,J.D.Mol.Med. Today1999,5,216)和心血管活動(Shryock,J.C. ;Belardinelli,L.Am.J.Cardiol. 1997, 79, 2)中發(fā)揮作用并且作為信號傳導分子(Schachter,J.B. ;Yasuda,R.P. ;Wolfe, B.B.CellSignaling1995, 7. 659)發(fā)揮作用。核苷及其類似物用于治療癌癥、抗病毒感染 和AIDS。例如,吉西他濱(Giessrigl,B?等.HumanMolecularGenetics,2012,21(21), 4615-4627 ;Hertel,L.ff. ;Kroin,J.S. ;Misner,J.ff. ;Tustin,J.M.J.Org.Chem. 1988, 53, 2406 ;Plunkett,W. ;Huang,P. ;Ganghi,V.NucleosidesNucleotides,1997,16,1261) 被批準用于治療胰腺癌并且AZT(3'-疊氮基-2' 3'-雙脫氧胸苷)被批準用于治療 HIV(人類免疫缺陷病毒)。其他實例包括FMAU((氟-L-阿拉伯呋喃糖基)-5_甲基尿 啼啶,克來夫定(〇16¥11(1;[116))(町6匕6,1.1.等.0111'代1^1^(1;[(^11&1'1]1&〇6111:;[0&18,2012, 5(1),38-46 ;Chu,C.K?等.Antimicrob.AgentsChemother.,1995,6,979)、FIAC(非西 他濱,(氣L-阿拉伯咲喃糖基)_5_ 鵬胞啼啶)(Prichard,Mark.;AntiviralResearch, 2006,71(1),1-6)、卩1^(阿洛夫定,3'-氟-胸苷)(厶8&以&1,11.1(.出1^吐6^,1(.1 ; Buckheit,R.ff. ;Parang,K.Bioorganic&MedicinalChemistryLetters,2012,22 (17), 5451-5454 ;Balzarini,J. ;Baba,ML,Pauwels,R.,Herdewijn,P.,DeClercq,E.Biochem. Pharmacol. 1988, 37, 2847)、F-ddC(2, 3-二脫氧-2-氟-0 -d-蘇-呋喃戊糖基)-胞嘧啶, 2-氟雙脫氧胞苷)(Okabe,M. ;Sun,R.-C;Zenchoff,G.B.J.Org.Chem. 1991,56,4392)以 及SFDC(l-(2-脫氧-2-C-氟甲基阿拉伯呋喃糖基)胞嘧啶)(YoshimuraY. ;Saitoh,K.; Ashida,N.;SakataS. ;Matsuda,A.BioorganicMed.Chem.Lett.,1994,4,721) 0
[0026] 核苷可分為兩個主要亞型,N_核苷和C_核苷,其中糖部分的異頭碳與堿基之間分 別通過堿基的氮或碳來連接。此外,其中糖環(huán)氧被硫、磷、氮和碳替換的核苷分別稱為硫代 核苷(丫〇1?)5^1]1&,]\135〇11:116818,2000,1637)、磷代核苷(¥&1]1&811;[七&,]\1;1(&1:〇,¥.;3112111<:;[, K. ;Reddy,P.M. ;0shikawa,T.Abstractsof29thCongressofHeterocyclicChemistry, 1998,461)、氣雜核昔(Yokoyama,M. ;Momotake,A.Synthesis,1999,1541)和碳環(huán)核昔 (Akella,LakshmiB. ;Vince,RobertFromTetrahedron(1996),52(25),8407-8412 ; Crimmins,M.T.Tetrahedron,1998, 54,9229)0
[0027] 從天然來源分離的瓶菌素A(neplanocinA)和(_)芒霉素((-)aristeromycin) 是碳環(huán)核苷亞家族的成員。盡管其強大的抗病毒活性,但是僅對這些核苷進行了有限的結 構活性關系(SAR)研究。該不足的主要原因是在制備D-碳環(huán)糖中的合成困難,因此主要在 堿基部分上進行了修飾。
[0028] 合成碳環(huán)糖的常規(guī)方法具有路線長的缺點,其不允許大規(guī)模制備。例如,在2000 年,Chu組在8個步驟中將D-甘油醛轉化為E-烯烴(一種中間體)。該中間體經(jīng)歷分子 內親核取代以提供氟-環(huán)戊稀框架(Gumina,G. ;Chong,Y. ;Choi,Y.Chu,C.K.0rg.Lett., 2000,2,1229)。使用類似的中間體來給出1,6-二烯,所述1,6-二烯烴歷使用Grubbs催 化劑的環(huán)環(huán)化易位(ringcyclizationmetathesis,RCM) (Chong,Y. ;Gumina,G. ;Chu, C.K.Tetrahedron:Asymmetry,2000,1 1,4853)。在 2005 年,Schmeller和Yin(Yin.X.-Q.; Schneller,S