本發(fā)明涉及生物工程,更具體地說,它涉及一種調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、栽培種花生(arachis?hypogaea?l.)是我國重要的油料作物和經(jīng)濟作物,其單產(chǎn)、總產(chǎn)、出口量及產(chǎn)值在五大油料作物中穩(wěn)居首位。我國年需食用植物油的自給率僅為30%,但目前糧油爭地矛盾突出,花生種植面積難以擴大。因此,有效揭示花生產(chǎn)量性狀形成分子機理,通過遺傳改良來提高單產(chǎn)是緩解花生生產(chǎn)供不應(yīng)求現(xiàn)狀的有效途徑。盡管自上世紀(jì)50年代以來經(jīng)歷了五次主要的花生品種更新,其產(chǎn)量已有了顯著提高,但對于花生產(chǎn)量潛力的挖掘以及超高產(chǎn)花生新品種的培育仍有可提升的空間。
2、花生生產(chǎn)中,制約產(chǎn)量的因素較多,如種子大小、單株產(chǎn)量、單株結(jié)果數(shù)、株型等都會直接影響產(chǎn)量。其中,花生種子性狀是決定單位面積產(chǎn)量的關(guān)鍵因素之一,也是衡量其商品特性的重要指標(biāo),挖掘其關(guān)鍵基因?qū)μ剿髑v果大小發(fā)育的調(diào)控機理以及花生高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)分子育種具有重要的理論意義和應(yīng)用價值。同時,特大粒花生較普通花生在國際市場價格近高一倍,培育籽仁更大花生新品種也是花生產(chǎn)業(yè)的迫切需求撐。
3、近年來栽培種花生“tifrunner”、“獅頭企”和“伏花生”的全基因組信息陸續(xù)公布,為花生重要農(nóng)藝性狀基因的定位和功能鑒定提供重要參考。目前雖然報道了較多的花生籽仁性狀相關(guān)qtls(quantitative?trait?loci),但這些qtls物理區(qū)間較大,關(guān)鍵控制性狀基因還在挖掘當(dāng)中,相關(guān)性狀形成分子機理尚不明確,阻滯了花生分子育種應(yīng)用的研究。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、針對現(xiàn)有技術(shù)存在的不足,本發(fā)明的目的在于提供一種調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因及其應(yīng)用,其基因序列為seq?id?1。
2、進一步地,所述調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的cdna序列為seq?id?2。
3、進一步地,所述調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因編碼的蛋白序列為seq?id3。
4、本發(fā)明的第二個目的在于提供一種篩選調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的方法,所述方法通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(gwas)和遺傳圖譜定位連鎖分析(qtl?mapping)聯(lián)合分析,利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析基因差異表達以及同源性分析的方式實現(xiàn)。
5、進一步地,所述篩選調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的方法可應(yīng)用于花生、小麥、水稻、大豆、玉米等其它作物的功能基因篩選。
6、本發(fā)明的第三個目的在于提供一種調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的應(yīng)用,該基因能夠調(diào)控種子的大小和粒重。
7、本發(fā)明還提供了一種調(diào)控花生種子大小和粒重的snp分子標(biāo)記,所述分子標(biāo)記位于栽培種花生第16號染色體的第149251594位堿基(arachis?hypogaea?cv.tifrunner?v1;https://www.peanutbase.org),經(jīng)過pamrs基因分型,將分型結(jié)果分為兩組,根據(jù)相應(yīng)的表型數(shù)進行t檢驗,結(jié)果顯示當(dāng)該位點基因型為g時,花生種子大小和粒重值較大,當(dāng)該位點為c時,花生種子小且粒重值較低。arahy16:149251594位堿基具有c/g多態(tài)性。
8、綜上所述,本發(fā)明具有以下有益效果:
9、第一、本發(fā)明首次發(fā)現(xiàn)了調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因,通過研究驗證該基因能夠調(diào)控種子的大小和粒重。
10、第二、本發(fā)明提供了一種使用gwas-qtl聯(lián)合分析的方法篩選出與花生特定功能相關(guān)候選基因的方法,有效發(fā)掘到與花生重要產(chǎn)量性狀相關(guān)的新基因,為實現(xiàn)花生產(chǎn)量性狀改良及加快高產(chǎn)分子聚合育種進程提供研究依據(jù)。
11、第三、本發(fā)明的調(diào)控種子的大小和粒重的基因ahfmo,其異源過表達證實能夠增加擬南芥種子的長度、寬度以及粒重。
1.一種調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因,其特征在于,所述調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的序列為seq?id?1。
2.如權(quán)利要求1所述的調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因,其特征在于,所述調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的cdna序列為seq?id?2。
3.如權(quán)利要求1所述的調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因,其特征在于,所述調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因編碼的蛋白序列為seq?id?3。
4.一種篩選如權(quán)利要求1所述的調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因方法,其特征在于,所述方法通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(gwas)和遺傳圖譜定位連鎖分析(qtl?mapping)聯(lián)合分析,利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析基因差異表達情況,同源性分析以及候選基因過表達驗證的方式實現(xiàn)。
5.如權(quán)利要求4所述的篩選調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的方法,其特征在于,所述方法可應(yīng)用于花生、小麥、水稻、大豆、玉米等其它作物的功能基因篩選。
6.一種如權(quán)利要求1所述的調(diào)控花生種子大小和粒重的ahfmo基因的應(yīng)用,其特征在于,所述ahfmo基因能夠調(diào)控種子的大小和粒重。
7.一種分子標(biāo)記,其特征在于,所述snp標(biāo)記位于花生第16號染色體的第149251594位堿基,當(dāng)該位點基因型為g時,花生種子大小和粒重值較大,當(dāng)該位點為c時,花生種子大小和粒重值較小。