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基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)

文檔序號(hào):39728739發(fā)布日期:2024-10-22 13:32閱讀:2來源:國(guó)知局
基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)

本發(fā)明屬于胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)領(lǐng)域,尤其涉及一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)。


背景技術(shù):

1、本部分的陳述僅僅是提供了與本發(fā)明相關(guān)的背景技術(shù)信息,不必然構(gòu)成在先技術(shù)。

2、由于胰腺的解剖位置隱蔽、早期病變難以發(fā)現(xiàn),且大部分pdac(胰腺導(dǎo)管腺癌)缺乏明確的癥狀,能夠用于診斷的生物標(biāo)志物也很少,導(dǎo)致大約80-85%的患者在診斷時(shí)就已經(jīng)不能切除或轉(zhuǎn)移。即使是一小部分確診為局部可切除腫瘤的患者,其預(yù)后仍很差,5年生存率僅為20%。pdac(胰腺導(dǎo)管腺癌)的病因復(fù)雜,菌群可能也與其發(fā)病有關(guān),例如口腔?,F(xiàn)有的研究表明,健康對(duì)照者和胰腺癌患者的口腔微生物組成不同,但口腔菌群和胰腺菌群之間的關(guān)系不明確,也未聯(lián)合胰腺部位本身的菌群確定出預(yù)測(cè)pdac的生物標(biāo)志物組合,導(dǎo)致無法基于口腔菌群定量預(yù)測(cè)出胰腺導(dǎo)管腺癌患病概率,并且無法為醫(yī)生提供更加量化的精確決策性建議。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、為了解決上述背景技術(shù)中存在的技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng),其能夠?yàn)獒t(yī)生提供更加量化的精確決策性建議。

2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:

3、本發(fā)明的第一個(gè)方面提供一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法。

4、一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其包括:

5、獲取待測(cè)者的潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息;

6、利用所述生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及預(yù)先訓(xùn)練的多元統(tǒng)計(jì)模型,得到患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值;

7、其中,通過對(duì)胰腺導(dǎo)管腺癌患者群和胰腺良性疾病患者群的唾液、十二指腸液和胰腺組織樣本進(jìn)行微生物組間差異分析,將其中的差異菌取交集,得到潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合;

8、在所述多元統(tǒng)計(jì)模型的訓(xùn)練中,訓(xùn)練樣本由所述生物標(biāo)記物集合中的各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及其對(duì)應(yīng)屬性標(biāo)簽構(gòu)成;所述屬性標(biāo)簽包括胰腺導(dǎo)管腺癌患者及胰腺良性疾病患者。

9、本發(fā)明的第二個(gè)方面提供一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)系統(tǒng)。

10、一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)系統(tǒng),其包括:

11、相對(duì)豐度信息獲取模塊,其用于獲取待測(cè)者的潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息;

12、胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)模塊,其用于利用所述生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及預(yù)先訓(xùn)練的多元統(tǒng)計(jì)模型,得到患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值;

13、其中,通過對(duì)胰腺導(dǎo)管腺癌患者群和胰腺良性疾病患者群的唾液、十二指腸液和胰腺組織樣本進(jìn)行微生物組間差異分析,將其中的差異菌取交集,得到潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合;

14、在所述多元統(tǒng)計(jì)模型的訓(xùn)練中,訓(xùn)練樣本由所述生物標(biāo)記物集合中的各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及其對(duì)應(yīng)屬性標(biāo)簽構(gòu)成;所述屬性標(biāo)簽包括胰腺導(dǎo)管腺癌患者及胰腺良性疾病患者。

15、本發(fā)明的第三個(gè)方面提供一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)。

16、一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其上存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,該程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)如上述所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法中的步驟。

17、本發(fā)明的第四個(gè)方面提供一種計(jì)算機(jī)設(shè)備。

18、一種計(jì)算機(jī)設(shè)備,包括存儲(chǔ)器、處理器及存儲(chǔ)在存儲(chǔ)器上并可在處理器上運(yùn)行的計(jì)算機(jī)程序,所述處理器執(zhí)行所述程序時(shí)實(shí)現(xiàn)如上述所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法中的步驟。

19、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是:

20、(1)本發(fā)明利用潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及多元統(tǒng)計(jì)模型,預(yù)測(cè)患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值,構(gòu)建出口腔菌群和胰腺菌群之間的關(guān)系,實(shí)現(xiàn)了聯(lián)合胰腺部位本身的菌群確定出預(yù)測(cè)胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)志物組合,基于口腔菌群定量預(yù)測(cè)出胰腺導(dǎo)管腺癌患病概率,能夠?yàn)獒t(yī)生提供更加量化的精確決策性建議,以輔助醫(yī)生為診斷胰腺導(dǎo)管腺癌結(jié)果提供數(shù)據(jù)支撐。

21、(2)本發(fā)明公開的生物標(biāo)志物具有較高的準(zhǔn)確度和特異性,具有良好的開發(fā)為診斷方法的前景,從而為pdac的患病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估、診斷、早期診斷,尋找潛在藥物靶點(diǎn)提供依據(jù);基于口腔菌群的pdac生物標(biāo)志物組合作為檢測(cè)靶點(diǎn)或檢測(cè)目標(biāo)在制備檢測(cè)試劑盒中的應(yīng)用;基于口腔菌群的pdac生物標(biāo)志物組合作為靶點(diǎn)在篩選治療和/或者預(yù)防pdac的藥物中的應(yīng)用;生物標(biāo)志物組合相對(duì)豐度的變化為確定候選藥物是否有效提供依據(jù)。

22、本發(fā)明附加方面的優(yōu)點(diǎn)將在下面的描述中部分給出,部分將從下面的描述中變得明顯,或通過本發(fā)明的實(shí)踐了解到。



技術(shù)特征:

1.一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,包括:

2.如權(quán)利要求1所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,將患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值與預(yù)設(shè)概率閾值進(jìn)行比較,若前者大于后者,則預(yù)測(cè)相應(yīng)待測(cè)者為胰腺導(dǎo)管腺癌患者;否則,預(yù)測(cè)相應(yīng)待測(cè)者為胰腺良性疾病患者。

3.如權(quán)利要求1所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,所述多元統(tǒng)計(jì)模型為rf模型。

4.如權(quán)利要求1所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,所述生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息由測(cè)序方法得到。

5.如權(quán)利要求1所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,所述生物標(biāo)記物集合由如下生物標(biāo)記物構(gòu)成:

6.一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)系統(tǒng),其特征在于,包括:

7.如權(quán)利要求6所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)系統(tǒng),其特征在于,在所述胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)模塊中,將患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值與預(yù)設(shè)概率閾值進(jìn)行比較,若前者大于后者,則預(yù)測(cè)相應(yīng)待測(cè)者為胰腺導(dǎo)管腺癌患者;否則,預(yù)測(cè)相應(yīng)待測(cè)者為胰腺良性疾病患者。

8.如權(quán)利要求6所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法,其特征在于,所述多元統(tǒng)計(jì)模型為rf模型。

9.一種計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì),其上存儲(chǔ)有計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,該程序被處理器執(zhí)行時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1-5中任一項(xiàng)所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法中的步驟。

10.一種計(jì)算機(jī)設(shè)備,包括存儲(chǔ)器、處理器及存儲(chǔ)在存儲(chǔ)器上并可在處理器上運(yùn)行的計(jì)算機(jī)程序,其特征在于,所述處理器執(zhí)行所述程序時(shí)實(shí)現(xiàn)如權(quán)利要求1-5中任一項(xiàng)所述的基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法中的步驟。


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明屬于胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)領(lǐng)域,提供了一種基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)。其中,基于口腔菌群的胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)測(cè)方法包括獲取待測(cè)者的潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息;利用所述生物標(biāo)記物集合中各個(gè)生物標(biāo)記物的相對(duì)豐度信息及預(yù)先訓(xùn)練的多元統(tǒng)計(jì)模型,得到患胰腺導(dǎo)管腺癌的概率值;其中,通過對(duì)胰腺導(dǎo)管腺癌患者群和胰腺良性疾病患者群的唾液、十二指腸液和胰腺組織樣本進(jìn)行微生物組間差異分析,將其中的差異菌取交集,得到潛在診斷胰腺導(dǎo)管腺癌的生物標(biāo)記物集合。

技術(shù)研發(fā)人員:李真,朱逸清,梁瀟,李理想,馮強(qiáng),支夢(mèng)凡,張國(guó)明,陳昶旭,王逸凡,鐘寧
受保護(hù)的技術(shù)使用者:山東大學(xué)齊魯醫(yī)院
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2024/10/21
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