基孔肯亞病毒序列的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及一種生物醫(yī)學技術(shù)領(lǐng)域，尤其涉及一段基孔肯亞病毒序列。
【背景技術(shù)】
[0002] 基孔肯亞熱是由基孔肯亞病毒（CHIKV)引起，經(jīng)伊蚊傳播，以發(fā)熱、皮瘆及關(guān)節(jié)疼 痛為主要特征的急性傳染病。1952年首次在坦桑尼亞證實了基孔肯雅熱流行，1956年分離 到病毒。本病主要流行于非洲和東南亞地區(qū)，近年在印度洋地區(qū)造成了大規(guī)模流行。由于 基孔肯亞是由蚊蟲傳播的，因此，這種傳染病主要是在冬季溫度在18°C以上的地區(qū)流行。我 們應(yīng)提高警惕，加強檢疫，消滅蚊子，嚴防基孔肯亞熱蔓延。在目前尚未研制出有效疫苗和 治療方法。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003] 本發(fā)明的目的在于，通過生物信息學和分子生物學技術(shù)確定了一段基孔肯亞病毒 序列及其PCR引物，該序列和相應(yīng)的PCR引物可用于建立基因芯片和PCR方法進行基孔肯 亞熱疾病的診斷。
[0004] 為了實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明所采用的技術(shù)方案如下：一段基孔肯亞病毒序列及其 PCR引物，用引物進行PCR擴增，其序列如下：
【主權(quán)項】
1.基孔肯亞病毒序列及其PCR引物，用引物進行PCR擴增，其特征在于，其序列如下： (1) Igb〇-〇ra-virus-LNA-fragment tgtccgagag aggaccttaa cgtgctgttg cctgtgggca ttcagaaagc acaagacgca 60 tacggtgtac aaaagaccgg atacccagtc aatccaaaag gtccctgctg aatttgacag 120 cttcgtgata ccaagtctgt ggt 143 (2) Onyong-nyong-virus-LNA-fragment tgtccgagag aggaccttaa catgctgttg cctatgggca ttcagaaagc ataagacgca 60 tacggtgtac aaaagaccgg atacccagtc aatccaaaag gtccctgctg aatttgacag 120 cttcgtgata ccaagcctgt ggt 143 (3) CHKV-consense-LNA-fragment ggtcagagaa agaacactga cctgctgctg tctatgggca ttcaagaagc agaaaaacac 60 acggtctaca agaggcctga tacccagtca attcagaagg ttcaggccga gtttgacagc 120 tttgtggtac cgagtctgtg gtcgtccggg ttgtcaatcc ctttgaggac tagaatcaaa 180 tggttgttaa gcaaggt 197 (4) Igb〇-〇ra-virus-standard-fragment attccgcata catcattacc agcagtgtgt agatcacgca atgaagctcc agatgctagg 60 gggggactct ctacggctgt taaagccggg aggttcactt ctgattagag cttacgggta 120 cgccgaccga accagtgaaa ggg 143 (5) Onyong-nyong-virus-standard-fragment attccgcata catcattacc agcagtgtgt agatcacgca atgaagctcc agatgctagg 60 gggggactct ctacggctgt taaagccagg aggttcactt ctgattagag cttacgggta 120 cgccgaccga accagtgaaa ggg 143 (6) CHKV-consense-standard-fragment ttttcgcata caccattacc aacagtgcgt cgaccacgca atgaaactgc aaatgctcgg 60 gggtgactca ttgagactgc tcaaaccggg cggctctcta ttgatcagag catatggtta 120 cgcagataga accagtgaac gagtcatctg cgtattggga cgcaagttta gatcgtctag 180 agcgttg 187 引物的序列： (1) 正向引物序列 gtcagagaaagaacactr ttcgcatacacyaytacy (2) 反向引物序列 cttgcttaacarccayttg gctctagacgatckaaacttr 探針的序列： 5' -FAM-cmtGctGtcGcyTrtgg-BHQl-3'（LNA 探針） 5'-FAM-TCGTTCRCTKGCTCTMTCTGCGT-BHQ1-3' 。
【專利摘要】本發(fā)明涉及一段基孔肯亞病毒序列及其PCR引物，用引物進行PCR擴增，獲得該序列，所得的測序序列進行blast比對，確信均為目的基因序列無疑，該段基孔肯亞病毒序列為研究基孔肯亞的產(chǎn)生和作用機理提供依據(jù)，且對建立的臨床檢測技術(shù)所使用的方法具有快速、準確、操作簡便等優(yōu)點。
【IPC分類】C12N15-11, C12R1-93, C12Q1-68
【公開號】CN104745692
【申請?zhí)枴緾N201510106109
【發(fā)明人】張貽琛, 李雷
【申請人】普生（天津）科技有限公司
【公開日】2015年7月1日
【申請日】2015年3月10日