本發(fā)明涉及診斷視神經(jīng)脊髓炎的方法，特別是使用miRNA標(biāo)志物區(qū)分性診斷視神經(jīng)脊髓炎(NMO)與多發(fā)性硬化(MS)的方法。
背景技術(shù)：
：最近，分子診斷已經(jīng)具有越來越高的重要性。分子診斷已經(jīng)發(fā)現(xiàn)進(jìn)入疾病的臨床診斷(尤其是傳染性病原的檢測、基因組突變的檢測、患病細(xì)胞的檢測以及疾病易感性的風(fēng)險因子的識別)。特別是，通過測定組織中的基因表達(dá)，核酸分析展示了疾病的研究與診斷中非常有前景的新的可能性。待檢測的感興趣的核酸包括基因組DNA、表達(dá)的mRNA和其他RNA，如微RNA(縮寫為miRNA)。miRNA是具有各種各樣生物學(xué)功能的一個新的小RNA類別(A.Keller等，NatMethods.20118(10):841-3)。它們是在真核細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的短的(平均為20-24個核苷酸)核糖核酸(RNA)分子。在哺乳動物中已經(jīng)識別出數(shù)百個不同種類的微RNA(即，數(shù)百個不同序列)。它們對于轉(zhuǎn)錄后的基因調(diào)控是重要的，而且結(jié)合到靶信使RNA轉(zhuǎn)錄物(mRNA)的互補(bǔ)序列上，這可以導(dǎo)致翻譯抑制或靶降解以及基因沉默。因此它們也可以用作用于研究、診斷和治療目的的生物學(xué)標(biāo)志物。視神經(jīng)脊髓炎(NMO)是一種罕見的障礙，其在多個方面類似于多發(fā)性硬化(MS)，但是需要不同的治療過程。這兩種疾病具有類似的癥狀，但是NMO患者不可以使用McDonald標(biāo)準(zhǔn)和磁共振斷層成像進(jìn)行診斷。而且，沒有允許區(qū)分NMO與MS的經(jīng)過驗證的生物標(biāo)志物。診斷最初是通過尋找視神經(jīng)炎和脊髓牽連的癥狀而同時排除由腦中的損傷所產(chǎn)生的癥狀的臨床診斷，即，基于健康調(diào)查(既往病歷)和神經(jīng)檢查。為了確認(rèn)這種診斷，測定水通道蛋白-4抗體以及對頭骨和脊柱進(jìn)行磁共振成像是必要的，以及對于區(qū)分性診斷，腰椎穿刺、誘發(fā)電位和可能的肌電圖/神經(jīng)電圖是必要的。NMO與MS的可靠區(qū)分在疾病早期并不總是可能的。如果患者額外出現(xiàn)了指向牽連視神經(jīng)之外的腦的癥狀，這會帶來有疑問的診斷。另一種綜合征——球后視神經(jīng)炎——也可以影響視覺，但按照定義保持不牽涉脊髓。多發(fā)性硬化(MS)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的一種炎癥性自身免疫性疾病，其中腦和脊髓的軸突周圍的髓鞘受損，導(dǎo)致脫髓鞘和瘢痕形成以及廣譜的臨床體征和癥狀。MS可以分類為不同疾病亞型，包括復(fù)發(fā)/緩解型MS(RRMS)、繼發(fā)進(jìn)展型MS、原發(fā)進(jìn)展型MS、進(jìn)展復(fù)發(fā)型MS。復(fù)發(fā)-緩解亞型的特征在于不可預(yù)見的復(fù)發(fā)，接著是沒有新的疾病活動跡象的數(shù)月到數(shù)年時間的相對平息期(緩解)。復(fù)發(fā)-緩解亞型通常以臨床孤立綜合征(CIS)開始。在CIS中，患者表明脫髓鞘的發(fā)作。通常，CIS標(biāo)志著MS的發(fā)病。多發(fā)性硬化的診斷通常包括分析不同的臨床數(shù)據(jù)、成像數(shù)據(jù)和實驗室數(shù)據(jù)。一些患者在接受疾病診斷之前在患有MS的情況下存活多年。因此，對于有效、簡單、可靠的NMO診斷測試，特別是可以區(qū)分NMO與MS的診斷測試，存在未被滿足的需求。定義除非另有規(guī)定，本文使用的技術(shù)和科學(xué)術(shù)語具有與本發(fā)明所屬領(lǐng)域內(nèi)的普通技術(shù)人員所通常理解的相同的含義。如本文所用，術(shù)語“視神經(jīng)脊髓炎”或“NMO”涉及視神經(jīng)和牽連的脊髓的復(fù)發(fā)性炎癥性和脫髓鞘性疾病，并且意在包括疾病的所有臨床階段和亞型。其通常也稱為德維克病。如本文所用，術(shù)語“多發(fā)性硬化”或“MS”涉及神經(jīng)系統(tǒng)的炎癥性疾病，并且意在包括疾病的所有臨床階段和亞型，包括MS的臨床孤立癥狀(CIS)、復(fù)發(fā)/緩解型MS(RRMS)、繼發(fā)進(jìn)展型MS、原發(fā)進(jìn)展型MS和進(jìn)展復(fù)發(fā)型MS。如本文所用，術(shù)語“預(yù)測(疾病的)預(yù)后”意在同時包括預(yù)測經(jīng)歷給定治療的患者的結(jié)果和預(yù)后未經(jīng)治療的患者。在本發(fā)明的含義中，“預(yù)后”定義為疾病過程中達(dá)到的確定情況。這種疾病預(yù)后可以例如是臨床情況，如“疾病復(fù)發(fā)”、“疾病緩解”、“治療響應(yīng)”、疾病階段或等級，等等?！帮L(fēng)險”理解為受試者或患者發(fā)生或達(dá)到某個疾病結(jié)果的概率。在本發(fā)明的上下文中，術(shù)語“風(fēng)險”并非意在帶有任何關(guān)于患者健康的正面或負(fù)面涵義，而僅僅是指給定事件或情況出現(xiàn)或發(fā)生的概率或可能性。術(shù)語“臨床數(shù)據(jù)”涉及關(guān)于患者健康狀態(tài)的全部可得數(shù)據(jù)和信息，包括但不限于年齡，性別，體重，更年期/激素狀態(tài)，疾病發(fā)生學(xué)數(shù)據(jù)，既往病歷數(shù)據(jù)，通過體外診斷方法如血液或尿液測試獲得的數(shù)據(jù)，通過成像方法如x射線、計算機(jī)斷層顯像、MRI、PET、單光子發(fā)射計算機(jī)化斷層顯像、超聲獲得的數(shù)據(jù)，電生理學(xué)數(shù)據(jù)，遺傳分析，基因表達(dá)分析，活檢評估，術(shù)中發(fā)現(xiàn)。如本文所用，術(shù)語患者“樣品分類”涉及使所述樣品與至少兩種類別中的至少一種關(guān)聯(lián)。這些類別可以是，例如“高風(fēng)險”和“低風(fēng)險”，高、中和低風(fēng)險，其中風(fēng)險是某個時間段內(nèi)某個事件出現(xiàn)的概率，例如疾病出現(xiàn)、疾病進(jìn)展等。其還可以表示有利或不利的疾病臨床結(jié)果、對于給定治療的響應(yīng)性或不響應(yīng)性等等的類別。分類可以通過使用算法，特別是判別函數(shù)進(jìn)行。算法的簡單實例是根據(jù)高于或低于某個閾值的第一定量參數(shù)(例如感興趣的核酸的表達(dá)水平)的分類。患者樣品分類可以用于預(yù)測疾病預(yù)后或者發(fā)生疾病的風(fēng)險?？梢允褂酶信d趣的多個核酸的組合評分，而非使用感興趣的單一核酸的表達(dá)水平。而且，額外的數(shù)據(jù)可以與第一定量參數(shù)組合使用。這種額外數(shù)據(jù)可以是來自患者的臨床數(shù)據(jù)，如性別、年齡、患者體重、疾病分級，等等?！芭袆e函數(shù)”是用于分類對象或事件的一組變量的函數(shù)。判別函數(shù)因此允許根據(jù)可從患者、樣品或事件獲得的數(shù)據(jù)或參數(shù)，將所述患者、樣品或事件分類到一個類別或多個類別。這種分類是本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的統(tǒng)計分析的標(biāo)準(zhǔn)方法。例如，患者可能根據(jù)從所述患者、樣品或事件獲得的數(shù)據(jù)被分類為“高風(fēng)險”或“低風(fēng)險”，“需要治療”或“不需要治療”，或者其他類別。分類不限于“高與低”，而是可以實施為多個類別、分級等等。允許分類的判別函數(shù)的實例包括但不限于通過支持向量機(jī)(SVM)、k最近鄰(kNN)、(樸素)貝葉斯模型定義的判別函數(shù)，或者例如在子群發(fā)現(xiàn)中、在決策樹中、在數(shù)據(jù)邏輯分析(LAD)中的分段定義函數(shù)，等等。術(shù)語“表達(dá)水平”是指，例如，感興趣的核酸的測定表達(dá)水平。術(shù)語“表達(dá)水平譜(pattern)”是指與例如來自對照的參比核酸或者與例如DNA芯片分析中的計算平均表達(dá)值相比較的測定表達(dá)水平。譜不限于兩種基因的比較，而是還涉及基因與參比基因或樣品的多重比較。某個“表達(dá)水平譜”還可以通過比較和測量多種后文公開的感興趣的核酸得到和測定，并且顯示這些轉(zhuǎn)錄物相對于彼此的豐度。表達(dá)水平還可以相對于在不同組織、患者與健康對照等中的表達(dá)而評估。在本發(fā)明的含義中，“參比表達(dá)水平譜”應(yīng)理解為可用于與另一表達(dá)水平譜相比較的任意表達(dá)水平譜。在本發(fā)明的優(yōu)選實施方式中，參比表達(dá)水平譜是例如在用作參比組的一組健康或患病個體中觀察到的平均表達(dá)水平譜。在本發(fā)明的上下文中，“樣品”或“生物樣品”是從生物體獲得或者已經(jīng)與生物體接觸的樣品。生物樣品的實例是：細(xì)胞、組織、體液、活檢樣本、血液、尿液、唾液、痰、血漿、血清、細(xì)胞培養(yǎng)上清液等等?！疤结槨笔悄軌蚺c特定生物分子特異性結(jié)合或相互作用的分子或物質(zhì)。術(shù)語“引物”、“引物對”或“探針”應(yīng)具有分子生物學(xué)領(lǐng)域中的技術(shù)人員已知的這些術(shù)語的通常含義。在本發(fā)明的優(yōu)選實施方式中，“引物”、“引物對”和“探針”是指寡核苷酸或多核苷酸分子，所述寡核苷酸或多核苷酸分子具有與待檢測或定量的靶分子或靶序列的區(qū)域相同、互補(bǔ)、同源(homologous)、是其同源物(homologues)的序列，使得引物、引物對或探針可以與靶分子(例如待檢測或定量的靶核酸、RNA、DNA、cDNA、基因、轉(zhuǎn)錄物、肽、多肽或蛋白質(zhì))特異性結(jié)合。如本文所理解的，引物可以自身用作探針。如本文所理解的，“探針”也可以包含例如引物對與內(nèi)部標(biāo)記探針的組合，如眾多可商購qPCR方法中常見的?！盎颉笔呛幸允芸胤绞疆a(chǎn)生功能性RNA產(chǎn)物所必需的信息的核酸片段的集合?！盎虍a(chǎn)物”是通過基因的轉(zhuǎn)錄或表達(dá)所產(chǎn)生的生物分子，如mRNA或翻譯的蛋白質(zhì)?！癿iRNA”是短的、天然存在的RNA分子，并且應(yīng)具有本領(lǐng)域技術(shù)人員所理解的通常含義?！霸醋詍iRNA的分子”是從miRNA模板化學(xué)地或酶促地獲得的分子，如cDNA。術(shù)語“陣列”是指裝置例如芯片裝置上的可尋址位置的布置。位置的數(shù)量可以在數(shù)個至數(shù)百或數(shù)千的范圍內(nèi)。每個位置代表獨立的反應(yīng)位點。陣列包括，但不限于，核酸陣列、蛋白質(zhì)陣列和抗體陣列?！昂怂彡嚵小笔侵负泻怂崽结樔绻押塑账帷⒍嗪塑账峄蚧虻妮^大部分的陣列。陣列上的核酸優(yōu)選是單鏈的?！拔㈥嚵小笔侵干镄酒蛏飳W(xué)芯片，即具有固定的探針的離散區(qū)域密度為至少約100/cm2的區(qū)域的陣列?！盎赑CR的方法”是指包括聚合酶鏈反應(yīng)PCR的方法。這是通過使用一個、兩個或更多個引物進(jìn)行體外酶復(fù)制而指數(shù)擴(kuò)增核酸(例如DNA或RNA)的方法。對于RNA擴(kuò)增，可以使用反轉(zhuǎn)錄作為第一步驟?；赑CR的方法包括特別適合于分析表達(dá)水平的動態(tài)或定量PCR(qPCR)。在談到表達(dá)水平的測定時，基于PCR的方法可以例如通過(1)在反轉(zhuǎn)錄酶的幫助下將完整的mRNA池(所謂的轉(zhuǎn)錄物組)反轉(zhuǎn)錄成cDNA，以及(2)在相應(yīng)引物的幫助下檢測給定cDNA的存在而用于檢測給定mRNA的存在。這種方法通常稱為反轉(zhuǎn)錄酶PCR(rtPCR)。術(shù)語“基于PCR的方法”包括端點PCR應(yīng)用以及應(yīng)用特定熒光體或插入染料的動態(tài)/實時PCR技術(shù)二者，所述熒光團(tuán)或插入染料發(fā)射隨擴(kuò)增的靶變化的熒光信號，并允許監(jiān)測和定量靶。定量方法可以是通過外標(biāo)曲線的絕對定量或相對于比較性內(nèi)標(biāo)的相對定量。術(shù)語“下一代測序”或“高通量測序”是指使測序過程并行的高通量測序技術(shù)，一次產(chǎn)生數(shù)千或數(shù)百萬個序列。實例包括大規(guī)模平行簽名測序(MPSS)、聚合酶克隆測序、454焦磷酸測序、Illumina(Solexa)測序、SOLiD測序、離子半導(dǎo)體測序、DNA納米球測序、Helioscope(TM)單分子測序、單分子SMRT(TM)測序、單分子實時(RNAP)測序，納米微孔DNA測序。術(shù)語“標(biāo)志物”或“生物標(biāo)志物”是指生物分子，例如核酸、肽、蛋白質(zhì)、激素等，其存在或濃度可以被檢測并與已知情況如疾病狀態(tài)相關(guān)聯(lián)，或者與臨床結(jié)果如對治療的響應(yīng)相關(guān)聯(lián)。發(fā)明目的本發(fā)明的技術(shù)問題是提供允許診斷多發(fā)性硬化、預(yù)測發(fā)生多發(fā)性硬化的風(fēng)險或預(yù)測多發(fā)性硬化的預(yù)后的生物標(biāo)志物。技術(shù)實現(xiàn)要素：在詳細(xì)描述本發(fā)明之前，應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明不限于所描述的方法的處理步驟的特定組成部分，因為這些方法可以變化。還應(yīng)當(dāng)理解，本文所使用的術(shù)語僅僅是出于描述特定實施方式的目的，而不旨在是限制性的。必須注意，如本說明書和隨附權(quán)利要求書中所使用的，除非上下文另外明確指出，否則單數(shù)形式“一(a)”、“一(an)”和“該(the)”包括單數(shù)和/或復(fù)數(shù)指示物。還應(yīng)當(dāng)理解，除非上下文明確規(guī)定，否則復(fù)數(shù)形式包括單數(shù)和/或復(fù)數(shù)指示物。此外，應(yīng)當(dāng)理解，在給出由數(shù)值限定的參數(shù)范圍的情況下，認(rèn)為這些范圍包括這些限制值。在其最一般的說法中，本發(fā)明涉及可用于診斷、預(yù)后和預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎，特別是區(qū)分NMO與MS(包括CIS/RRMS)的miRNA標(biāo)志物的集合。本發(fā)明涉及一種用于在患有視神經(jīng)脊髓炎或者處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中的患者中診斷視神經(jīng)脊髓炎、預(yù)測發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險或者預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的方法，所述方法包括以下步驟：a)在來自所述患者的樣品中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平，所述miRNA選自以下miRNA種類：hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p，hsa-miR-28-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-943，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-1287-5p，hsa-miR-3605-3p，hsa-miR-4448，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-942-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-3150a-5p，hsa-miR-6762-3p，hsa-miR-505-5p，hsa-let-7f-5p，hsa-miR-6819-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p，hsa-miR-411-3p，hsa-miR-301b，hsa-miR-6505-3p，hsa-miR-671-3p，hsa-miR-3934-5p，hsa-miR-1304-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-4775，hsa-miR-493-3p，hsa-miR-451b，hsa-miR-548ac，hsa-miR-4662a-5p，hsa-miR-548q，hsa-miR-409-5p，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-937-3p，hsa-miR-651-5p，hsa-miR-188-5p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-4504，hsa-miR-4635，hsa-miR-548n，hsa-miR-3128，hsa-miR-421，hsa-miR-6783-5p，hsa-miR-3677-3p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-7-5p，hsa-miR-548t-3p，hsa-miR-450b-5p，其還在表1中列出；b)比較步驟a)中測定的表達(dá)水平譜與一個或多個參比表達(dá)水平譜；以及c)從步驟b)中的比較結(jié)果診斷視神經(jīng)脊髓炎、預(yù)測發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險或者預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后。進(jìn)一步地，本發(fā)明涉及一種將患有視神經(jīng)脊髓炎或者處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中的患者的樣品分類的方法，所述方法包括以下步驟：a)在來自所述患者的樣品中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平，所述miRNA選自以下miRNA種類：hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p，hsa-miR-28-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-943，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-1287-5p，hsa-miR-3605-3p，hsa-miR-4448，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-942-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-3150a-5p，hsa-miR-6762-3p，hsa-miR-505-5p，hsa-let-7f-5p，hsa-miR-6819-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p，hsa-miR-411-3p，hsa-miR-301b，hsa-miR-6505-3p，hsa-miR-671-3p，hsa-miR-3934-5p，hsa-miR-1304-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-4775，hsa-miR-493-3p，hsa-miR-451b，hsa-miR-548ac，hsa-miR-4662a-5p，hsa-miR-548q，hsa-miR-409-5p，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-937-3p，hsa-miR-651-5p，hsa-miR-188-5p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-4504，hsa-miR-4635，hsa-miR-548n，hsa-miR-3128，hsa-miR-421，hsa-miR-6783-5p，hsa-miR-3677-3p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-7-5p，hsa-miR-548t-3p，hsa-miR-450b-5p，其還在表1中列出；b)比較步驟a)中測定的表達(dá)水平譜與一個或多個參比表達(dá)水平譜；以及c)從步驟b)中的比較結(jié)果將所述患者的樣品分類到至少兩個種類中的一個中，所述種類指示視神經(jīng)脊髓炎的診斷、發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險的預(yù)測或者視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的預(yù)測。這種分類可以指示視神經(jīng)脊髓炎的診斷、發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險的預(yù)測或者視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的預(yù)測。所述種類可以是健康/患病、低風(fēng)險/高風(fēng)險、發(fā)生疾病的低風(fēng)險/高風(fēng)險，等等。優(yōu)選地，2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15或更多種miRNA的表達(dá)水平可以在來自所述患者的所述樣品中測定。參比表達(dá)水平譜可以通過在至少一個健康受試者或至少一個患有MS(包括CIS/RRMS)的受試者中測定該至少一種miRNA的表達(dá)水平而獲得。將數(shù)值賦予步驟a)中測定的至少一種miRNA的表達(dá)水平在本發(fā)明的范圍內(nèi)。通過應(yīng)用算法以獲得相對于參比表達(dá)水平譜的歸一化表達(dá)水平而將算法應(yīng)用于執(zhí)行步驟b)也在本發(fā)明的范圍內(nèi)。將算法應(yīng)用于步驟a)中測定的至少一種miRNA的表達(dá)水平數(shù)值以獲得疾病評分而允許分類樣品或者診斷、預(yù)后視神經(jīng)脊髓炎或預(yù)測發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險或預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后是在本發(fā)明的范圍內(nèi)。這種算法的非限制性實例是將表達(dá)水平的數(shù)值針對閾值進(jìn)行比較，以將結(jié)果分類到兩種類別之一中，例如高風(fēng)險/低風(fēng)險、患病/健康等。這種算法的另一非限制性實例是組合多個表達(dá)水平數(shù)值(例如通過求和)以獲得組合評分。可以通過與代表miRNA表達(dá)水平的因子或數(shù)值、代表臨床數(shù)據(jù)的數(shù)值或其他因子相乘來標(biāo)準(zhǔn)化或加權(quán)單個被加數(shù)。應(yīng)用判別函數(shù)來分類結(jié)果、診斷疾病、預(yù)測預(yù)后或風(fēng)險是在本發(fā)明的范圍內(nèi)。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，樣品選自血液樣品、血清樣品和血漿樣品。根據(jù)本發(fā)明的進(jìn)一步方面，樣品是血液樣品。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，本發(fā)明的方法包括在步驟a)中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平，所述miRNA選自以下miRNA種類：hsa-miR-6131，hsa-miR-5094，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-4504，hsa-miR-4301，hsa-miR-4635，hsa-miR-548n，hsa-miR-3128，hsa-miR-421，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-943，hsa-miR-6783-5p，hsa-miR-3677-3p，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-7-5p，hsa-miR-548t-3p，hsa-miR-450b-5p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-505-5p，如表2中列出的。根據(jù)這個方面，所述方法可以特別用于確定所述患者是否患有視神經(jīng)脊髓炎或者處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，所述方法包括在步驟a)中測定miRNA：hsa-miR-6131的表達(dá)水平。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，本發(fā)明的方法包括從步驟b)和/或c)的結(jié)果確定患者是患有視神經(jīng)脊髓炎還是患有多發(fā)性硬化，或者是處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中還是處于發(fā)生多發(fā)性硬化的風(fēng)險中。根據(jù)本發(fā)明的這個方面(包括確定患者是患有NMO還是患有MS，或者是處于發(fā)生NMO的風(fēng)險中還是處于發(fā)生MS的風(fēng)險中)，本發(fā)明的方法包括在步驟a)中測定選自miRNA種類hsa-miR-6131和hsa-miR-127-3p的至少一種miRNA的表達(dá)水平。根據(jù)本發(fā)明的這個方面(包括確定患者是患有NMO還是患有MS，或者是處于發(fā)生NMO的風(fēng)險中還是處于發(fā)生MS的風(fēng)險中)，本發(fā)明的方法包括在步驟a)中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平，所述miRNA選自以下miRNA種類：hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3phsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p，hsa-miR-28-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-943，hsa-miR-3127-5p，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-1287-5p，hsa-miR-3605-3p，hsa-miR-4448，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-942-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-3150a-5p，hsa-miR-6762-3p，hsa-miR-505-5p，hsa-let-7f-5p，hsa-miR-6819-3p，如表3中列出的。根據(jù)本發(fā)明的這個方面(包括確定患者是患有NMO還是患有MS，或者是處于發(fā)生NMO的風(fēng)險中還是處于發(fā)生MS的風(fēng)險中)，本發(fā)明的方法包括在步驟a)中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平，所述miRNA選自以下miRNA種類：hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p，hsa-miR-411-3p，hsa-miR-301b，hsa-miR-6505-3p，hsa-miR-671-3p，hsa-miR-3934-5p，hsa-miR-1304-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-4775，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-493-3p，hsa-miR-451b，hsa-miR-411-5p，hsa-miR-548ac，hsa-miR-4662a-5p，hsa-miR-548q，hsa-miR-409-5p，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-937-3p，hsa-miR-651-5p，hsa-miR-188-5p，如表4中列出的。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，本發(fā)明的方法包括在步驟a)中測定至少一種選自miRNA種類hsa-miR-6131和hsa-miR-127-3p的miRNA，以及選自在表1、2、3和4中列出的miRNA種類的至少一種另外的miRNA的表達(dá)水平。根據(jù)這個方面，優(yōu)選地，2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、15或更多種另外的miRNA的表達(dá)水平可以在來自所述患者的所述樣品中測定。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，優(yōu)選地，待使用的miRNA標(biāo)志物的標(biāo)志物或組合包括以下標(biāo)志物組合，或者由以下標(biāo)志物組合組成：-hsa-miR-6131；-hsa-miR-127-3p；-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p；-hsa-miR-6131，hsa-miR-5094；-hsa-miR-6131，hsa-miR-5094，hsa-miR-223-5p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-5094，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-5094，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p,-hsa-miR-6131，hsa-miR-5094，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-4714-5p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6798-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6501-5p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-454-5p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，-hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p,-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，-hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6735-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-6818-3p，-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p,和-hsa-miR-223-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p。根據(jù)本發(fā)明的一個方面，步驟(a)中表達(dá)水平的測定是通過使用選自基于測序的方法、基于陣列的方法和基于PCR的方法的方法而獲得。本發(fā)明進(jìn)一步涉及一種用于在患有視神經(jīng)脊髓炎或者處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中的患者中診斷視神經(jīng)脊髓炎、預(yù)測發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險或者預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的試劑盒，所述試劑盒包括：-用于在來自所述患者的所述樣品中測定至少一種miRNA的表達(dá)水平的裝置，所述miRNA選自hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p，hsa-miR-28-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-943，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-1287-5p，hsa-miR-3605-3p，hsa-miR-4448，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-942-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-3150a-5p，hsa-miR-6762-3p，hsa-miR-505-5p，hsa-let-7f-5p，hsa-miR-6819-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p，hsa-miR-411-3p，hsa-miR-301b，hsa-miR-6505-3p，hsa-miR-671-3p，hsa-miR-3934-5p，hsa-miR-1304-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-4775，hsa-miR-493-3p，hsa-miR-451b，hsa-miR-548ac，hsa-miR-4662a-5p，hsa-miR-548q，hsa-miR-409-5p，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-937-3p，hsa-miR-651-5p，hsa-miR-188-5p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-4504，hsa-miR-4635，hsa-miR-548n，hsa-miR-3128，hsa-miR-421，hsa-miR-6783-5p，hsa-miR-3677-3p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-7-5p，hsa-miR-548t-3p，hsa-miR-450b-5p，其還在表1中列出；以及-用于與來自所述樣品的至少一種miRNA的表達(dá)水平相比較的至少一個參比表達(dá)水平譜。用于測定所述至少一種miRNA的表達(dá)水平的裝置可以包括用于檢測或擴(kuò)增所述至少一種miRNA的寡核苷酸探針，用于以基于陣列的方法、基于PCR的方法、基于測序的方法為基礎(chǔ)測定表達(dá)水平的裝置，或者用于測定表達(dá)水平的任何其他適合裝置。參比表達(dá)水平譜可以作為數(shù)字信息，特別是作為任何適合的信息載體上的計算機(jī)編碼信息提供。本發(fā)明進(jìn)一步涉及一種用于在患有視神經(jīng)脊髓炎或者處于發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險中的患者中診斷視神經(jīng)脊髓炎、預(yù)測發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險或者預(yù)測視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的計算機(jī)程序產(chǎn)品，其包括：-用于接收代表患者樣品中至少一種miRNA的表達(dá)水平的數(shù)據(jù)的裝置，所述miRNA選自hsa-miR-6131，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-181a-2-3p，hsa-miR-6775-3p，hsa-miR-454-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-23b-3p，hsa-miR-6840-5p，hsa-miR-4301，hsa-miR-6798-3p，hsa-miR-6513-3p，hsa-miR-28-5p，hsa-miR-181b-5p，hsa-miR-943，hsa-miR-6501-5p，hsa-miR-1287-5p，hsa-miR-3605-3p，hsa-miR-4448，hsa-miR-3127-3p，hsa-miR-942-5p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-4755-3p，hsa-miR-3150a-5p，hsa-miR-6762-3p，hsa-miR-505-5p，hsa-let-7f-5p，hsa-miR-6819-3p，hsa-miR-127-3p，hsa-miR-223-5p，hsa-miR-3912-3p，hsa-miR-5094，hsa-miR-6818-3p，hsa-miR-1468-5p，hsa-miR-379-3p，hsa-miR-411-3p，hsa-miR-301b，hsa-miR-6505-3p，hsa-miR-671-3p，hsa-miR-3934-5p，hsa-miR-1304-5p，hsa-miR-4753-3p，hsa-miR-4775，hsa-miR-493-3p，hsa-miR-451b，hsa-miR-548ac，hsa-miR-4662a-5p，hsa-miR-548q，hsa-miR-409-5p，hsa-miR-1908-3p，hsa-miR-937-3p，hsa-miR-651-5p，hsa-miR-188-5p，hsa-miR-548b-5p，hsa-miR-4714-5p，hsa-miR-6735-3p，hsa-miR-4504，hsa-miR-4635，hsa-miR-548n，hsa-miR-3128，hsa-miR-421，hsa-miR-6783-5p，hsa-miR-3677-3p，hsa-miR-6737-3p，hsa-miR-486-3p，hsa-miR-7-5p，hsa-miR-548t-3p，hsa-miR-450b-5p，其還在表1中列出；-用于接收代表用于與來自所述樣品的至少一種miRNA的表達(dá)水平相比較的至少一個參比表達(dá)水平譜的數(shù)據(jù)的裝置，-用于比較所述代表患者樣品中至少一種miRNA的表達(dá)水平的數(shù)據(jù)的裝置；以及-用于從步驟b)中的比較結(jié)果確定視神經(jīng)脊髓炎的診斷、發(fā)生視神經(jīng)脊髓炎的風(fēng)險的預(yù)測或者視神經(jīng)脊髓炎的預(yù)后的預(yù)測的裝置。所述計算機(jī)程序產(chǎn)品可以提供在可存儲電子介質(zhì)上，如固態(tài)存儲器、磁盤、CD等。所述計算機(jī)程序產(chǎn)品可以存儲在適于在一個或多個計算機(jī)上操作的非暫時性計算機(jī)可讀介質(zhì)上，所述計算機(jī)可讀介質(zhì)包括：含有其的存儲介質(zhì)。它可以本地存儲在計算機(jī)上。它可以作為的基于網(wǎng)絡(luò)的程序或應(yīng)用(包括基于網(wǎng)或互聯(lián)網(wǎng)的應(yīng)用)而實施。它可以在診斷裝置如分析儀器中實施。它可以可操作地連接到用于輸出信息的裝置，如顯示器、打印機(jī)等。實施例在以下相應(yīng)實施例的描述和附圖中進(jìn)一步公開了本發(fā)明的目的的額外細(xì)節(jié)、特征、特性和優(yōu)勢，所述實施例以示例性方式示出了本發(fā)明的優(yōu)選實施方式。然而，這些實施例決不應(yīng)被理解為限制本發(fā)明的范圍。本發(fā)明涉及使用miRNA生物標(biāo)志物區(qū)分性診斷視神經(jīng)脊髓炎(NMO)與多發(fā)性硬化(MS)的方法。多發(fā)性硬化(MS)的診斷在具有非典型表現(xiàn)的患者中和在可能與炎癥性脫髓鞘相關(guān)的先期神經(jīng)缺陷期間可能是具有挑戰(zhàn)性的。特別是，難以區(qū)分NMO與MS(包括CIS/RRMS)，其通常呈現(xiàn)疾病的最早期階段。然而，特別期望獲得用于這種區(qū)分的可靠診斷測試。為了識別用于診斷NMO的生物標(biāo)志物，通過使用下一代測序、微陣列分析和qRT-PCR，對來自患有經(jīng)確認(rèn)的NMO、臨床孤立綜合征(CIS)或復(fù)發(fā)緩解型MS(RRMS)的未治療患者以及匹配對照的全血樣品中的miRNA表達(dá)譜進(jìn)行全面分析。在患有NMO的患者中，識別出顯著失調(diào)的miRNA。這些miRNA可以潛在地將來用作診斷生物標(biāo)志物?；颊吆蜆悠分苽湓赑AXgeneBloodRNA管(BectonDickinson，Heidelberg，Germany)中從患者/對照收集約5ml血液。按照制造商的建議，使用PAXgeneBloodmiRNA試劑盒(Qiagen)分離包括miRNA的總RNA。將分離的RNA儲存在-80℃。使用Bioanalyzer2100(Agilent)分析RNA完整性，并使用NanoDrop2000(thermoScientific)測量濃度和純度。NGS篩選首先，對來自第一群組中患有NMO的X個患者、Y1個CIS/RRMS患者以及第二群組中的Y2個CIS/RRMS患者以及Z個對照的38個樣品進(jìn)行高通量篩選。分析總共約3000個miRNA標(biāo)志物。表1顯示了發(fā)現(xiàn)在患有NMO的患者中顯著失調(diào)的mRNI標(biāo)志物。第二列是指序列表的SEQIDNO。表1.使用TruSeqSmallRNA樣品制備試劑盒(Illumina)產(chǎn)生多重測序文庫，其隨后使用50bp片段測序方案在HiSeq2000系統(tǒng)(Illumina)上測序。使用CASAVA1.8軟件包(Illumina)對所得測序閱讀片段進(jìn)行多路解編，并使用FastQC工具(BabrahamInst.)檢查質(zhì)量。使用miRDeep2-pipeline進(jìn)行初步作圖分析以確保已經(jīng)測序顯著比例的miRNA。平均來說，每個樣品獲得了1.5-2百萬個高質(zhì)量測序閱讀片段(總共9千5百萬個閱讀片段)，其中高達(dá)70％含有miRNA信息。首先通過切割3'接頭序列預(yù)處理原始illumina閱讀片段。這通過FASTX工具包中的程序fastx_clipper完成。去除剪接后短于18個核苷酸的閱讀片段。折疊剩余的閱讀片段，即在該步驟后，僅獲得獨特閱讀片段及其每樣品的頻率。該步驟大大減少了閱讀片段作圖的時間。對于剩余的步驟，使用miRDeep2-pipeline。這些步驟包括將閱讀片段對基因組(hg19)進(jìn)行作圖，將閱讀片段對來自mirbasereleasev18的miRNA前體序列進(jìn)行作圖，匯總樣品的計數(shù)和預(yù)測新的miRNA。表2、3和4顯示了分別在患有NMO的患者與對照相比或者在兩個不同對照群組中顯著失調(diào)的標(biāo)志物。在表2、3和4中：-中值gl涉及對照(表2)或CIS/RRMS患者(表3和4)中的閱讀片段的中位數(shù)；-中值g2涉及NMO患者的閱讀片段的中位數(shù)；-q中值是中值g2/中值g2的比率，ttest_rawp表示使用t檢驗的原始p值的顯著性；-AUC表示接受者/操作者曲線(ROC)的曲線下面積。表2顯示了發(fā)現(xiàn)在患有NMO的患者中與對照相比顯著失調(diào)的標(biāo)志物。表2：15_dmat_對照_vs_nmo用于本發(fā)明的方法、試劑盒或計算機(jī)程序產(chǎn)品中的優(yōu)選標(biāo)志物組合包含或由以下組成：表2中列出的前2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12種標(biāo)志物。表3顯示了發(fā)現(xiàn)在患有NMO的患者中與患有經(jīng)確認(rèn)的CIS或RRMS形式的MS的患者的第一群組相比顯著失調(diào)的標(biāo)志物。表3：dmat_cis+rrms(1)_nmomiRNA中值g1中值g2q中值ttest_rawpAUChsa-miR-181a-2-3p157,66396878,4858302,0088210,0000080,933333hsa-miR-6775-3p1,004049112,9190280,0088920,0000760,042424hsa-miR-454-5p118,97570929,1619434,0798280,0000900,939394hsa-miR-6735-3p1,00404969,4210530,0144630,0001530,063636hsa-miR-23b-3p142,17408960,0627532,3670920,0003290,906061hsa-miR-613170,3056681,00404970,0221770,0003370,854545hsa-miR-6840-5p1,00404986,0647770,0116660,0004590,115152hsa-miR-43011,00404973,4251010,0136740,0004930,096970hsa-miR-6798-3p1,00404977,6862350,0129240,0005310,045455hsa-miR-6513-3p137,88259145,5182193,0291740,0006070,854545hsa-miR-28-5p147,92915060,5506072,4430660,0007370,896970hsa-miR-181b-5p145,61538575,1376521,9379820,0010710,854545hsa-miR-181b-5p143,31578974,8097171,9157380,0010950,854545hsa-miR-9431,004049100,4939270,0099910,0015410,121212hsa-miR-3127-5p1,00404991,8765180,0109280,0015840,136364hsa-miR-6501-5p20,684211113,6396760,1820160,0017010,157576hsa-miR-1287-5p1,00404986,0647770,0116660,0017320,127273hsa-miR-3605-3p109,68016273,7327941,4875360,0018160,872727hsa-miR-44481,004049102,7611340,0097710,0018440,130303hsa-miR-3127-3p50,874494138,8663970,3663560,0022340,121212hsa-miR-942-5p152,28542591,6882591,6609040,0024140,833333hsa-miR-6737-3p28,4392711,14979824,7341550,0025310,763636hsa-miR-4755-3p1,00404956,6740890,0177160,0027830,124242hsa-miR-3150a-5p1,00404956,6740890,0177160,0028910,106061hsa-miR-6762-3p1,00404956,6740890,0177160,0029990,090909hsa-miR-505-5p16,253036141,9554660,1144940,0030540,178788hsa-let-7f-5p101,78542543,3481782,3480900,0034800,833333hsa-miR-6819-3p1,00404956,3421050,0178210,0034840,093939hsa-miR-127-3p99,47773353,2024291,8697970,0034950,800000用于本發(fā)明的方法、試劑盒或計算機(jī)程序產(chǎn)品中的優(yōu)選標(biāo)志物組合包含或由以下組成：表3中列出的前2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12種標(biāo)志物。表4顯示了發(fā)現(xiàn)在患有NMO的患者中與患有經(jīng)確認(rèn)的CIS或RRMS形式的MS的患者的第一群組相比顯著失調(diào)的標(biāo)志物。表4：dmat_cis+rrms(2)_nmo中值g1中值g2q中值ttest_rawpAUChsa-miR-223-5p18,3643721,14979815,9718310,0000170,764463hsa-miR-6737-3p8,0111341,1497986,9674300,0002650,688017hsa-miR-3912-3p1,0040491,0040491,0000000,0003540,688017hsa-miR-50945,6670041,0040495,6441530,0004830,700413hsa-miR-61311,0040491,0040491,0000000,0005100,597107hsa-miR-6735-3p5,01113469,4210530,0721850,0006860,141529hsa-miR-6818-3p15,6690281,00404915,6058470,0006870,739669hsa-miR-1468-5p53,027328109,0708500,4861730,0007170,175620hsa-miR-379-3p1,0040491,0040491,0000000,0011280,727273hsa-miR-411-3p1,0040491,0040491,0000000,0021650,710744hsa-miR-301b1,0040491,0040491,0000000,0031100,628099hsa-miR-6505-3p6,0091092,7692312,1699560,0032020,607438hsa-miR-671-3p74,406883128,9959510,5768160,0036640,177686hsa-miR-3934-5p1,0040491,0040491,0000000,0037370,640496hsa-miR-1304-5p1,0040491,0040491,0000000,0040930,642562hsa-miR-4753-3p1,0040491,0040491,0000000,0041320,600207hsa-miR-127-3p95,41599253,2024291,7934520,0046860,739669hsa-miR-47751,0040491,0040491,0000000,0049420,652893hsa-miR-4755-3p2,68421156,6740890,0473620,0056000,162190hsa-miR-493-3p1,0040491,0040491,0000000,0058030,566116hsa-miR-451b1,0040491,0040491,0000000,0058680,634298hsa-miR-411-5p1,0040491,0040491,0000000,0058820,608471hsa-miR-548ac4,2398791,0040494,2227820,0059370,634298hsa-miR-4662a-Sp1,0040491,0040491,0000000,0062010,586777hsa-miR-548q1,5870452,6356280,6021510,0068220,543388hsa-miR-409-5p1,0040491,0040491,0000000,0069230,625000hsa-miR-1908-3p1,00404973,4251010,0136740,0091250,242769hsa-miR-937-3p121,62753050,0283402,4311730,0106180,721074hsa-miR-651-5p1,0040491,0040491,0000000,0114270,636364hsa-miR-188-5p1,0040491,1497980,8732390,0117090,550620用于本發(fā)明的方法、試劑盒或計算機(jī)程序產(chǎn)品中的優(yōu)選標(biāo)志物組合包含或由以下組成：表4中列出的前2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12種標(biāo)志物。總體上，顯示了NMO患者與對照和MS患者(包括CIS患者和RRMS患者)相比血液中miRNA表達(dá)的綜合分析。應(yīng)用NGS和微陣列分析，識別了88個miRNA的集合，其是顯著失調(diào)的。識別了允許區(qū)分NMO與健康對照或者NMO與MS的miRNA標(biāo)志物的子集。序列表<110>SiemensAG<120>視神經(jīng)脊髓炎中的診斷性miRNA譜<130>201325728<160>66<170>PatentInversion3.5<210>1<211>22<212>RNA<213>智人<400>1accacugaccguugacuguacc22<210>2<211>21<212>RNA<213>智人<400>2aggcccuguccucugccccag21<210>3<211>22<212>RNA<213>智人<400>3acccuaucaauauugucucugc22<210>4<211>22<212>RNA<213>智人<400>4aggccuguggcuccucccucag22<210>5<211>21<212>RNA<213>智人<400>5aucacauugccagggauuacc21<210>6<211>19<212>RNA<213>智人<400>6ggcuggucagaugggagug19<210>7<211>24<212>RNA<213>智人<400>7acccccgggcaaagaccugcagau24<210>8<211>20<212>RNA<213>智人<400>8ucccacuacuucacuuguga20<210>9<211>21<212>RNA<213>智人<400>9cuaccccccaucccccuguag21<210>10<211>21<212>RNA<213>智人<400>10ucaagugucaucugucccuag21<210>11<211>22<212>RNA<213>智人<400>11aaggagcucacagucuauugag22<210>12<211>23<212>RNA<213>智人<400>12aacauucauugcugucggugggu23<210>13<211>21<212>RNA<213>智人<400>13cugacuguugccguccuccag21<210>14<211>22<212>RNA<213>智人<400>14aguugccagggcugccuuuggu22<210>15<211>22<212>RNA<213>智人<400>15ugcuggaucagugguucgaguc22<210>16<211>23<212>RNA<213>智人<400>16ccuccguguuaccuguccucuag23<210>17<211>20<212>RNA<213>智人<400>17ggcuccuuggucuaggggua20<210>18<211>22<212>RNA<213>智人<400>18uccccuucugcaggccugcugg22<210>19<211>22<212>RNA<213>智人<400>19ucuucucuguuuuggccaugug22<210>20<211>22<212>RNA<213>智人<400>20ucugugcuucaccccuacccag22<210>21<211>22<212>RNA<213>智人<400>21agccaggcucugaagggaaagu22<210>22<211>22<212>RNA<213>智人<400>22caaccucgacgaucuccucagc22<210>23<211>23<212>RNA<213>智人<400>23uggcugcuucccuuggucuccag23<210>24<211>22<212>RNA<213>智人<400>24gggagccaggaaguauugaugu22<210>25<211>22<212>RNA<213>智人<400>25ugagguaguagauuguauaguu22<210>26<211>21<212>RNA<213>智人<400>26aagccucuguccccaccccag21<210>27<211>22<212>RNA<213>智人<400>27ucggauccgucugagcuuggcu22<210>28<211>22<212>RNA<213>智人<400>28cguguauuugacaagcugaguu22<210>29<211>21<212>RNA<213>智人<400>29uaacgcauaauauggacaugu21<210>30<211>22<212>RNA<213>智人<400>30aaucagugaaugccuugaaccu22<210>31<211>22<212>RNA<213>智人<400>31uugucucuuguuccucacacag22<210>32<211>21<212>RNA<213>智人<400>32cuccguuugccuguuucgcug21<210>33<211>22<212>RNA<213>智人<400>33uauguaacaugguccacuaacu22<210>34<211>22<212>RNA<213>智人<400>34uauguaacacgguccacuaacc22<210>35<211>23<212>RNA<213>智人<400>35cagugcaaugauauugucaaagc23<210>36<211>21<212>RNA<213>智人<400>36ugacuucuaccucuuccaaag21<210>37<211>21<212>RNA<213>智人<400>37uccgguucucagggcuccacc21<210>38<211>22<212>RNA<213>智人<400>38ucagguguggaaacugaggcag22<210>39<211>22<212>RNA<213>智人<400>39uuugaggcuacagugagaugug22<210>40<211>22<212>RNA<213>智人<400>40uucucuuucuuuagccuugugu22<210>41<211>22<212>RNA<213>智人<400>41uuaauuuuuuguuucggucacu22<210>42<211>22<212>RNA<213>智人<400>42ugaaggucuacugugugccagg22<210>43<211>22<212>RNA<213>智人<400>43uagcaagagaaccauuaccauu22<210>44<211>22<212>RNA<213>智人<400>44caaaaaccggcaauuacuuuug22<210>45<211>22<212>RNA<213>智人<400>45uuagccaauuguccaucuuuag22<210>46<211>22<212>RNA<213>智人<400>46gcuggugcaaaaguaauggcgg22<210>47<211>23<212>RNA<213>智人<400>47agguuacccgagcaacuuugcau23<210>48<211>21<212>RNA<213>智人<400>48ccggccgccggcuccgccccg21<210>49<211>22<212>RNA<213>智人<400>49auccgcgcucugacucucugcc22<210>50<211>22<212>RNA<213>智人<400>50uuuaggauaagcuugacuuuug22<210>51<211>21<212>RNA<213>智人<400>51caucccuugcaugguggaggg21<210>52<211>22<212>RNA<213>智人<400>52aaaaguaauugugguuuuggcc22<210>53<211>22<212>RNA<213>智人<400>53aacucugaccccuuagguugau22<210>54<211>22<212>RNA<213>智人<400>54aggccuguggcuccucccucag22<210>55<211>22<212>RNA<213>智人<400>55ugugacaauagagaugaacaug22<210>56<211>21<212>RNA<213>智人<400>56ucuugaagucagaacccgcaa21<210>57<211>22<212>RNA<213>智人<400>57caaaaguaauuguggauuuugu22<210>58<211>23<212>RNA<213>智人<400>58ucuggcaaguaaaaaacucucau23<210>59<211>23<212>RNA<213>智人<400>59aucaacagacauuaauugggcgc23<210>60<211>22<212>RNA<213>智人<400>60uaggggaaaaguccugauccgg22<210>61<211>22<212>RNA<213>智人<400>61cucgugggcucuggccacggcc22<210>62<211>22<212>RNA<213>智人<400>62ucugugcuucaccccuacccag22<210>63<211>21<212>RNA<213>智人<400>63cggggcagcucaguacaggau21<210>64<211>23<212>RNA<213>智人<400>64uggaagacuagugauuuuguugu23<210>65<211>25<212>RNA<213>智人<400>65aaaaaccacaauuacuuuugcacca25<210>66<211>22<212>RNA<213>智人<400>66uuuugcaauauguuccugaaua22當(dāng)前第1頁1 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